主人公·翔子是就读于流星学园中等部的中学生。和她很亲密的姐姐·响子，自从5年前去海外留学后就失去了行踪。
某天，身份不明者突然袭击了翔子。
袭击了她的是过去被女神雅典娜所封印的邪神厄里斯的手下·邪精灵。
于是翔子得知了雅典娜以及圣斗士、圣斗少女的存在，同时也知道了自己和姐姐的残酷宿命。
灵魂被封印的邪神厄里斯即将复活，邪精灵们也变得活跃。
在星矢等人展开银河战争以及与十二宫的恶斗的另一面，沙织和圣斗少女借助黄金圣斗士的力量，展开了与邪精灵的壮烈战斗！
并且，恶之撒加也有了复活的征兆……。
将一切的钥匙掌握在手的，是为了成为圣斗少女而刚刚开始锻炼的翔子！
即使被残酷的命运击倒，少女们仍然反抗命运。
少女们与诸神的壮烈战斗物语开幕！